この水族館の起源は1903年、「サンディエゴ海洋生物学協会」が最初の小さな水族館を開いたことにさかのぼる。この団体は後にUCサンディエゴのスクリプス海洋研究所となり、水族館はその一般向け普及拠点として成長した。ラホヤ・ショアーズを見下ろす丘の上にある現在の6万4,157平方フィートの建物は1992年に開館し、建設費の一部はスティーブン・アンド・メアリー・バーチ財団からの600万ドルの寄付でまかなわれた。
館内では約26万5,000リットルの巨大なケルプの森展示を含め、17万5,000リットルを超える海水がさまざまな展示を満たしており、直接触れられる潮だまりや、継続中の保全事業の一環として繁殖させたタツノオトシゴ、リーフィーシードラゴン、ウィーディーシードラゴンの展示もある。この水族館は、展示の多くを提供する研究機関のすぐ上に位置しているため、単なる娯楽にとどまらず現在進行中の実際の海洋科学とつながっていることが多く、海洋生物学に興味を持つ家族にとって見ごたえのある訪問先となっている。
入場料 すべての来館者は有料で入場し、公式サイトでは事前の時間指定チケットも販売されており、週末はその利用が勧められる。
行き方 MTSバスの路線がラホヤまで運行しており、水族館はラホヤ・ショアーズを見下ろす丘の上のキャンパスに独自の駐車場を備えている。