Fundado en 1874 como la Sociedad de Historia Natural de San Diego, este es el instituto científico más antiguo del sur de California y el segundo más antiguo al oeste del río Misisipi. Su sede permanente en Balboa Park abrió en 1933, y una gran ampliación en 2001 más que duplicó el tamaño del edificio, añadiendo una fachada posmoderna y un atrio de vidrio.
Las colecciones de investigación del museo incluyen cientos de miles de especímenes de insectos y reptiles, millones de invertebrados marinos, y amplios fondos de fósiles vinculados a su exhibición permanente Fossil Mysteries sobre la prehistoria de la región. Un nuevo Centro de Paleontología añadido en 2025 continúa el enfoque original del museo: documentar la historia natural específicamente de California y Baja California, en lugar del mundo en general.
Como las exhibiciones se centran en las plantas, animales y geología de esta región binacional específica, pueden servir también como una introducción al paisaje local para una familia recién llegada que aún no ha tenido la oportunidad de explorar en persona el desierto, la costa o las montañas cercanas.
Entrada La entrada tiene costo para todos los visitantes; el sitio oficial detalla los descuentos vigentes para residentes del condado.
Cómo llegar Las rutas locales de autobús de MTS dan servicio directo a Balboa Park, y la parada City College del tranvía conecta con un autobús hasta el parque.